El Consejo de Gobierno del Régimen Especial de Galápagos, dentro de sus atribuciones centra sus esfuerzo en planificar, construir, dictar las políticas, expedir normas y dictar lineamientos en los ámbitos de ordenamiento territorial, uso y gestión de suelo, migración y residencia, sistema vial, movilidad, control de ingreso de vehículos, saneamiento ambiental, energía alternativa, investigación y transferencia de tecnología.

Fomenta el desarrollo productivo y económico, la soberanía alimentaria y la participación ciudadana, ejecuta obras de infraestructura de orden público.  Coordina con las demás instituciones del estado la gestión de riesgos, el fomento a la educación, la cultura, el deporte, las actividades productivas.

En cumplimiento con la ciudadanía de la provincia de Galápagos, presenta su informe de rendición de cuentas 2016.